Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC127Q96BQ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms