Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM3DQ96BQ1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3DQ96BQ1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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