Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTI1AQ96AJ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTI1AQ96AJ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms