Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKD1Q969G9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKD1Q969G9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NKD1Q969G9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms