Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGGTAQ92696 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGGTAQ92696 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGGTAQ92696 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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