Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC4Q8WW27 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms