Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRUNE2Q8WUY3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRUNE2Q8WUY3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRUNE2Q8WUY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms