Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC7Q8WUI4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC7Q8WUI4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC7Q8WUI4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms