Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX29Q8TEQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX29Q8TEQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms