Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATJQ8NI35 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PATJQ8NI35 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PATJQ8NI35 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PATJQ8NI35 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PATJQ8NI35 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PATJQ8NI35 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PATJQ8NI35 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PATJQ8NI35 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms