Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF397Q8NF99 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF397Q8NF99 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF397Q8NF99 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms