Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHDC9Q8NEP7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms