Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSANTD4Q8NCY6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSANTD4Q8NCY6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms