Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPRYD3Q8NCJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SPRYD3Q8NCJ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPRYD3Q8NCJ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms