Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL23Q8NBE8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms