Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMGNT2Q8NAT1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms