Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLDN19Q8N6F1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CLDN19Q8N6F1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN19Q8N6F1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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