Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC33Q8N5R6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC33Q8N5R6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms