Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M1

ATPAF2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF2Q8N5M1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATPAF2Q8N5M1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATPAF2Q8N5M1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATPAF2Q8N5M1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms