Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHCHD4Q8N4Q1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD4Q8N4Q1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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