Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP3Q8IZU3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP3Q8IZU3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms