Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LOXHD1Q8IVV2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LOXHD1Q8IVV2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LOXHD1Q8IVV2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LOXHD1Q8IVV2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms