Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGDCC3Q8IVU1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGDCC3Q8IVU1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGDCC3Q8IVU1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms