Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX20Q7Z614 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX20Q7Z614 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms