Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTOP1Q7RTM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms