Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCQ7LC44 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCQ7LC44 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms