Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC8DQ7L1W4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8DQ7L1W4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms