Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYS1Q717R9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms