Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
USP34Q70CQ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP34Q70CQ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms