Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN12Q6ZSI9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN12Q6ZSI9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms