Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT7Q6ZNI0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT7Q6ZNI0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms