Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRSAM1Q6UWE0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRSAM1Q6UWE0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRSAM1Q6UWE0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms