Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DUX4L9Q6RFH8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX4L9Q6RFH8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms