Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms