Protein–RNA interactions for Protein: Q6P461

ACSM6, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM6Q6P461 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACSM6Q6P461 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACSM6Q6P461 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms