Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC27A4Q6P1M0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms