Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RGMBQ6NW40 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGMBQ6NW40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGMBQ6NW40 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms