Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUMO4Q6EEV6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SUMO4Q6EEV6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms