Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms