Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT79Q5XKE5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT79Q5XKE5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms