Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLX4IPQ5VYV7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLX4IPQ5VYV7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms