Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEF1A1P5Q5VTE0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EEF1A1P5Q5VTE0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms