Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF220Q5VTB9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms