Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
RPRD2Q5VT52 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RPRD2Q5VT52 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms