Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GKAP1Q5VSY0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GKAP1Q5VSY0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms