Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RSPH4AQ5TD94 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RSPH4AQ5TD94 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms