Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPM1JQ5JR12 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1JQ5JR12 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms