Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRDTQ58F21 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRDTQ58F21 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms