Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF394Q53GI3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF394Q53GI3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF394Q53GI3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms