Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM259Q4ZIN3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM259Q4ZIN3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms